A lo largo de su trayectoria ha destacado por crear historias dirigidas al público adulto, caracterizadas por un profundo análisis psicológico, personajes complejos y temas controvertidos. Entre sus obras más importantes se encuentran Ichi the Killer, Homunculus y Hikari-Man. De todas ellas, Homunculus es considerada su obra más representativa, ya que explora la mente humana, los traumas, la identidad y la percepción de la realidad mediante una historia original y llena de simbolismo.
Yamamoto es conocido por realizar una exhaustiva investigación antes de escribir sus mangas. Incluso llegó a convivir con personas sin hogar para documentar mejor algunos aspectos de Homunculus. Gracias a su estilo realista y a la profundidad de sus historias, es considerado uno de los autores más influyentes del manga psicológico contemporáneo y una figura destacada dentro del género seinen.




